درمان بیماری پاژه خارج پستانی معمولاً جراحی و برداشتن ضایعه می باشد. تعیین میزان پوستی که باید برداشته شود، دشوار است.

به ویژه هنگامی که ضایعات در سراسر ناحیه تناسلی و مقعد منتشر شده باشند. از آنجا که این بیماری عود کننده است، بیماران باید از 2 ماه پس از جراحی برای 2 سال آینده هر 2 ماه مجددا معاینه شوند. بعد از 2 سال، پیگیری ها به صورت سالانه می شوند.

در مواردی که جراحی به دلیل عود یا محل امکان پذیر نباشد، گزینه های درمانی دیگری وجود دارد

از جمله: عوامل شیمی درمانی مانند 5-فلوئورویوراسیل، ایمیکوایمود، پاکلیتاکسل، تراستوزوماب و دوکتاکسل و همچنین درمان با فتودینامیکی آمینولولولینیک اسید، لیزر ابلاسیون و پرتودرمانی. متأسفانه، مطالعات مربوط به اثربخشی گزینه های درمانی فوق فقط به صورت مطالعات موردی و بررسی کمی مقالات با پیگیری محدود موجود می باشند.